سطح زیر کشت پنبه در کشور حدود 90 هزار هکتار و میزان تولید 2 تن در هکتار است.  کل تولید پنبه در کشور حدود 160 هزار تن است که در مقایسه با تولید جهانی بسیار کم است که منجر به واردات سالانه حدود  60 هزار تن  پنبه می شود. برای کنترل آفات و بیماری ها در سال 4 تا 10 مرتبه مزارع پنبه سم پاشی می شو که ضمن افزایش هزینه کشاورزان، موجب آلودگی زیست محیطی می شود. با  توجه به موارد فوق، نیاز به جایگزینی ارقام تجاری موجود با ارقام پرمحصول و مقاوم به آفات و بیماری ها در کشور می باشد. فناوری مهندسی ژنتیک دارای قابلیت بالایی در ایجاد ارقام مقاوم به آفات و بیماری ها و تنش های غیر زنده است.در این راستا پژوهشکده با استفاده از راهبرد کارآمدسازی، اقدام به تولید پنبه تراریخته مقاوم به آفات نموده است.